胸腺瘤主要是通过手术切除来。手术方式包括全胸腺切除或肿瘤完整切除手术、姑息性切除。放疗对部分胸腺瘤有效，有时会用于术前，也可用于手术切除不彻底或恶性程度较高的胸腺瘤的术后治疗。化疗的作用有限。
目前大多也能微创胸腔镜下操作，需要根据胸腺瘤的大小、位置及与周围组织的关系判断。另外，如果合并有重症肌无力的情况，建议控制平稳重症肌无力症状之后再行手术的，否则术后容易引起肌无力危象，风险是比较大的。
胸腺瘤通常没有绝对良性，多少都具有一些外侵、转移或术后复发的特性。一旦确诊，患者需要到正规医院胸外科进行治疗，以免延误病情。
