皮脂腺囊肿主要位于真皮层内，属于皮肤内部结构，但部分可能因内容物积聚或感染向表皮外突出形成可见肿物。
其形成源于皮脂腺导管阻塞，导致腺体分泌的皮脂无法正常排出，在腺体内或导管内逐渐积聚，形成囊性结构。由于皮脂腺位于真皮层中，囊肿核心部分通常被包裹于真皮组织内，表面覆盖完整的表皮层。
在未发生感染或内容物过度积聚时，皮脂腺囊肿多表现为皮下圆形或椭圆形肿物，质地柔软或稍硬，边界清晰，可轻微移动，与表皮粘连但无破溃。此时囊肿完全位于皮肤内部，仅通过触摸或皮肤透光性检查可察觉异常。若囊内压力增高（如皮脂分泌旺盛、合并细菌感染）或受到外力挤压，囊肿可能向表皮方向膨胀，导致局部皮肤隆起，甚至突破表皮形成开放性窦道，排出豆腐渣样内容物，此时可见明显外在表现。
皮脂腺囊肿的位置还受解剖结构影响。头面部、颈部及躯干等皮脂腺分布密集区域更易发生，且囊肿大小可从数毫米至数厘米不等。无论是否突出表皮，其本质均为真皮层内的囊性病变，需通过手术切除完整囊壁以防止复发，单纯挤压或药物处理无法根治。
