胶囊内镜不能完全替代肠镜，多数胶囊内镜能完整检查结肠，该检查可以作为筛查方法，如果有必要的还应该考虑进行肠镜检查。
胶囊内镜属于非侵入性的检查，该检查较为舒适，可以应用于小肠或者结肠部位疾病的筛查，明确发病的部位。胶囊内镜不能替代结肠镜检查，胶囊内镜检查有一定的局限性，可以判断病变发病的部位，但在检查的时候不能对病变部位进行治疗以及活组织检查。如果胶囊内镜发现有结肠部位肿瘤病变的，还应该再进行结肠镜等检查，明确病变的性质。
如何选择检查的方式，要根据不同的患者、病情以及需求进行选择。
