甲减是有可能会导致雌二醇水平降低的。
在原发性甲减患者中，甲状腺激素合成和分泌减少，相应出现促甲状腺激素释放激素分泌增加，可调节泌乳素的水平升高，小剂量的泌乳素对女性卵巢雌激素、孕激素的合成起促进作用，而高泌乳素水平会干扰性腺的功能。
中枢性甲减中垂体性甲减也可以引起促甲状腺激素释放激素分泌增加，导致性激素分泌紊乱。
甲减患者机体代谢迟缓，肝脏性激素结合蛋白合成减少，继而则会导致睾酮及雌二醇降低；另外，甲减患者芳香化酶合成障碍，雄激素向雌激素转化障碍，同样会导致体内雌二醇水平降低。
因此甲减的女性患者会导致雌二醇水平降低，继而出现月经紊乱、不孕等情况，通过甲状腺素的替代治疗，甲功恢复正常后可得以改善。
