桥本甲状腺炎对怀孕是有影响的，研究发现桥本氏甲状腺炎，自身抗体阳性，甲状腺功能正常的孕妇自然流产和早产的风险增加；另一项研究显示对妊娠期甲状腺功能正常、TPOAb阳性的妇女给予小剂量左甲状腺素治疗，可以降低早产率和流产率。
而桥本氏甲状腺炎合并甲减的患者，即便是亚临床甲减，也是明确的会影响怀孕的，增加早产、流产、低体重儿、死胎的风险，并对胎儿的神经智力功能发育产生影响。
因此桥本氏甲状腺炎患者在备孕过程中，就需要观察甲功情况，对于甲减或仅TSH大于2.5mIU/L的妇女，需要开始启动左甲状腺素治疗，将TSH控制在小于2.5mIU/L再妊娠。妊娠期的治疗剂量要根据TSH水平决定，定期监测甲功，调整药物剂量。
