虽然肥胖常被描述为一种“内分泌”疾病，但有显著内分泌功能障碍的患者极少。
从病因方面分析，可能导致肥胖的因素包括：静态生活方式（平时不运动）、戒烟（出现生活、饮食、睡眠等紊乱）、饮食问题（怀孕和哺乳期过度进食、习惯过量饮食、喜欢高脂高糖饮食、高饮食频率、夜间饮食、常吃零食等）、心理疾病（焦虑、抑郁症、暴食症等）诸多因素。
有少数群体的肥胖是以某种疾病为原发病所导致的肥胖。这些疾病都很少见或罕见。
有部分群体的肥胖和药物有关，主要是一些精神类药物和激素。
还有极为罕见的情况，即基因缺陷性的肥胖。
