甲状腺异常可简单分为甲状腺功能异常、甲状腺形态异常两大类。
甲状腺功能异常常见的包括甲状腺功能亢进症、甲状腺功能减退、亚临床甲亢、亚临床甲减等。
对于甲状腺功能亢进者，一般使用抗甲状腺药物进行治疗，治疗周期较长，一般需要一年半到两年，但复发率较高。也可以选择放射性碘（也就是碘131）治疗以及手术治疗。导致甲减的风险较高。甲状腺功能减退补充甲状腺素治疗即可，只要保证甲功正常，对身体一般不会产生严重的影响。而亚临床甲亢、亚临床甲减要具体分析，一般成人可暂不治疗，寻找病因，定期复查。但孕妇亚临床甲减需要药物干预。儿童亚临床甲减要积极干预。
甲状腺形态异常一般包括甲状腺肿、良性甲状腺结节、甲状腺囊肿和甲状腺癌。
对于甲状腺癌患者绝大对数需要手术治疗，部分甲状腺乳头状微小癌（直径小于1cm）如果没有周围淋巴转移的，也可以暂缓手术，密切随诊。良性甲状腺肿、结节和囊肿患者，如果没有压迫症状，一般保守治疗，定期随诊。
