早上睡不醒，可能是由于身体过度疲劳，经过一晚上的休息仍不能恢复状态引起，也可能是由于夜晚睡眠时呼吸状况较差，造成机体缺氧，机体不能得到充分休息而引起。
机体在情绪紧张、精神压力过大等状态下，会导致睡眠欠佳，浅睡眠所占比重过长，深睡眠时间过短，不能使机体得到充分的休息，会导致早上疲乏、困倦。还有可能是环境过于嘈杂、温度及湿度不适宜造成睡眠质量差等。
另外一些躯体性疾病，如肺心病、慢性阻塞性肺疾病、睡眠呼吸暂停综合征、心功能不全等，可能造成大脑在夜间仍处于缺血缺氧的状态，机体得不到充分休息，因此患者也可能会表现出疲乏、劳累、早上睡不醒的症状。
