“巧克力囊肿”称为卵巢子宫内膜异位囊肿，是由于子宫内等症状。膜组织异位侵犯卵巢皮质，并在其内生长反复、周期性出血，形成单个或多个囊肿型的典型病变，囊肿内含暗褐色、似巧克力样糊状陈旧血性液体。该病在形态学上是良性表现，但在临床行为学上具有类似恶性肿瘤的特点，例如种植、侵蚀、远处转移等。巧克力囊肿极少发生恶变，发生率低于1%，恶变的细胞类型为透明细胞癌和子宫内膜样癌。该病的主要临床表现是继发性痛经进行性加重、不孕、性交疼痛等。
