一般情况下，若肛瘘瘘管引流通畅，患者可无明显疼痛。当瘘管发生堵塞，患者可感到明显疼痛，同时还会伴有其他全身感染症状，如乏力、发热等，切开排脓后症状缓解。
大部分肛瘘是由于直肠肛管周围脓肿引起，脓肿自行破溃或切开引流后在肛周皮肤形成外口。肛瘘一般难以自愈，手术治疗是治疗肛瘘的主要手段，要去除病灶，保证引流通畅。同时尽可能减少肛管括约肌的损伤，留取肛门的功能。常用的手术方法包括肛瘘切开术、挂线疗法、肛瘘切除术等。术后要做好护理，并养成良好的生活、饮食习惯，避免复发。
