亚急性甲状腺炎的治疗方法，根据症状轻重是有区别的，治疗以减轻炎症反应及缓解疼痛为目的。
轻症的亚急性甲状腺炎患者，可用乙酰水杨酸、非甾体消炎药等对症治疗。重症的亚急性甲状腺炎患者可使用糖皮质激素进行治疗，主要适用于疼痛剧烈、体温持续显著升高、水杨酸或其他非甾体消炎药治疗无效者，可迅速缓解疼痛，减轻甲状腺毒症症状。
治疗过程中必须根据症状、体征及ESR的变化，缓慢减少剂量，过快减量可使病情反复，一般总疗程6-8周以上。甲状腺毒症明显者，可以使用β受体阻滞剂。
由于本病并无甲状腺激素过量生成，故无需使用抗甲状腺药物治疗，少数患者会出现永久性甲减，则需要进行长期甲状腺激素替代治疗。
