髓母细胞瘤手术切除以后是需要化疗和放疗的。化疗和放疗可以显著降低肿瘤复发，对于3岁以内不适合放疗的孩子，化疗显得更加重要。特别是已经有播散转移的情况，多种化疗药物都有效，包括长春新碱、卡铂、顺铂、环磷酰胺、依托泊苷等。但这些化疗药物也都有各自的毒性。
对于儿童，要非常慎重，常见的并发症包括血液系统的骨髓抑制的现象，多指白细胞、血小板降低，同时会产生消化系统的并发症，比如肝功能损害、恶心、呕吐等症状，还经常会出现脱发的问题。随着化疗药物累积剂量的增大，这些副作用会越来越显著。但总体来讲，还是安全的，多数孩子是可以完成化疗的。
