如果输尿管结石不能自行排出，需要进一步采取体外冲击波碎石，并配合排石药物，多喝水，增加蹦跳运动，促进结石排出体外。
对于反复多次体外冲击波碎石，结石体积大小没有任何变化，位置没有任何移动，建议进行手术治疗，尽早去除结石，以免发生进一步的感染或肾功能损害等。对于结石较大或者是结石位置比较深，比如输尿管上段的结石，可配合微创手术，比如经皮肾镜碎石取石术、输尿管镜碎石取石术等。
对于巨大输尿管结石的患者，如果存在尿道狭窄，不适合做微创手术，必要时可进行开放/腹腔镜输尿管切开取石。
