巧克力囊肿如果不及时治疗，除了让女性痛经、月经不调、性交痛之外，还会导致不孕不育。卵巢巧克力囊肿，又称卵巢子宫内膜异位囊肿，是子宫内膜移植到卵巢后形成的卵巢囊肿。这种囊肿可能会随时间而逐渐增大，有时会在经期或经后发生破裂。同时，逐渐增大的囊肿也会渐渐侵蚀正常组织，造成卵巢组织不可逆的损害。目前，有3种方法可以治疗卵巢囊肿，一是传统手术，二是腹腔镜手术，三是经阴道超声介入手术。具体治疗方法还需要结合患者各项检查及具体情况选择合适方法进行治疗。
