胃肠穿孔的临床症状根据患者穿孔的部位不同，症状也是不同的。
临床上比较常见的胃肠道穿孔是胃十二指肠穿孔，胃十二指肠穿孔后，由于大量的胃液和肠液进入到腹腔内造成化学性腹膜炎，会出现剧烈的腹痛、面色苍白、恶心、呕吐、大汗淋漓。查体可见腹壁紧张，局部压痛明显，患者多采取蜷缩状体位，严重的患者会在短期内发生休克。
若穿孔出现在小肠或结肠部位，则疼痛症状相对比较轻微，部分患者可能会在发病数日后才去就医。患者会出现严重的腹膜刺激征的表现。
