脂肪肝是多种因素导致的。非酒精性脂肪肝和酒精性脂肪肝主要是由饮食引起，也包括其他因素，比如遗传、性别、肝病、营养不良等。
肥胖、二型糖尿病、高脂血症等情况会导致脂质摄入异常，线粒体功能障碍，肝细胞合成游离脂肪酸和甘油三酯增多，极低密度脂蛋白合成不足或者分泌减少，以致甘油三酯运出肝细胞减少。
以上情况会加剧肝细胞损害，最终导致肝细胞炎症坏死和纤维化。酒精中的乙醇会导致肝内血管收缩，血流减少，血流动力学紊乱，氧供减少以及酒精代谢氧耗增加，进一步加重低氧血症，导致肝功能恶化，
