先天性巨结肠的患者手术后可能会产生以下几种并发症：
第一，在手术过程中进行腹膜分离，可能会对输尿管造成损伤。在盆腔分离的过程中，如果损伤盆腔中的神经组织，会引起尿潴留。
第二，由于近端结肠游离不充分，做巨结肠手术后，因病变肠段切除后需做吻合术，会造成肠管回缩。
第三，如果吻合口有破裂，会使吻和口的血供变差，造成漏粪，从而引起感染等并发症。
第四，如果巨结肠的肠段切除不够，还可能会使患者的便秘复发。
