巧克力囊肿即为巧囊，一般考虑是由于异位的内膜组织转移到宫腔以外的部位所致。还可以考虑是由于机体的免疫功能下降、遗传、环境等因素导致。患者一般会出现痛经、性交疼痛、不孕等现象。一般认为巧囊是由于来月经的时候，经血通过输卵管逆流到腹腔，包裹了卵巢形成了一个巧克力囊肿，这就是人们经常说的经血倒流学说。另外还有一些免疫学说、淋巴转移学说等，最近还提出在位内膜决定论，也就是说内膜本身有问题，导致这部分患者经血逆流后容易形成巧囊。
