艾灸肚脐眼的功效有通经活络、行气止痛，通调三焦、利水消肿，健脾和胃、升清降浊，调理冲任、温补下元。
1.通经活络、行气止痛
脐通百脉，温热药贴脐后，能够通经活络，理气和血，达到“通则不痛”。适用于肠麻痹、痹症，手足麻木及诸酸痛证。
2.通调三焦、利水消肿
艾灸肚脐能激发三焦的气化功能，使气机畅通、经络疏通。用治小便不利、腹水、水肿、肥胖等。
3.健脾和胃、升清降浊
艾灸肚脐可增强脾胃机能，使阳气得升，浊阴下降，以健脾止泻，和胃降逆。用于胃痛、反胃、痞满、呕吐、泄泻等。
4.调理冲任、温补下元
冲为血海，任主胞胎，冲任督带与生殖及妇人的经带、胎、产息息相关，故艾灸肚脐可以调理冲任，理气养血，固经安胎。临床用于妇女月经不调、痛经、带下、崩漏、不孕及黄褐斑、面色萎暗等证。
