蜂巢具有健脾和胃、润肺、止咳的功效。蜂巢具有微小的毒性，不宜长期食用，长期食用可影响脾胃功能，导致腹泻症状的发生。
蜂巢是蜜蜂生活和繁殖后代的处所，通常情况下蜂巢中可残留一部分蜂王浆、蜂蜜及蜂胶等成分。一般蜂巢更多的是冲水喝，热水冲开，然后将蜂巢挤碎放到水中代茶饮用。避免在火上煎煮，可使得蜂巢的作用减弱。
此外，孕妇需避免食用蜂巢，其原因是蜂巢中含有一定量的激素或类激素物质，可能破坏体内的激素平衡导致宫缩、流产等情况的发生。
