肛瘘手术并不属于小手术，因为肛瘘手术涉及到肛门的解剖，主要包括肛门括约肌、提肛肌，在寻找内口时比较复杂，因此手术有一定的难度和风险。如果肛瘘手术病灶比较大，范围比较广，不是一个瘘道，而是复杂性瘘道，则治疗时更为复杂。
肛瘘手术主要包括瘘管切开术、挂线疗法、肛瘘切除术。肛瘘一旦形成，手术治疗也是唯一的治愈手段，治疗原则主要是使其成为开放的创面，从而达到逐渐愈合的目的。
手术后应保持局部卫生清洁，还要调理好饮食，避免吃刺激性发物食品，多喝水，保持大便通畅。
