溃疡性结肠炎和克罗恩病都是肠道的炎症性改变，可以通过以下方面进行鉴别：
溃疡性结肠炎血便、黏液便多一点，而克罗恩病以黄色水样便为主，且体重下降、发热等表现比溃疡性结肠炎更多见一些。溃疡性结肠炎腹痛可以不明显或者轻度腹痛，克罗恩病大多数有明显的腹痛，腹痛的原因是由于肠腔狭窄引起的或者是由于肠管浆膜周围的炎症引起的，同时克罗恩更多的是全身症状。
溃疡性结肠炎在镜检中可看到充血、水肿的黏膜，脆而易出血；而克罗恩病在镜下可见散在的、大小不一的口疮样溃疡，周围发红，溃疡之间由于黏膜下层炎症、水肿及纤维组织增生可呈现铺路卵石样改变。
