头顶正中间痛的原因主要有：血压升高、血管神经性头痛、颅内外肿瘤、脑血管病、局部炎症、外力作用、过敏反应、脑供血不足等。
血压升高后会使脑部的血管发生收缩引起头顶的正中间疼痛，使用降压药物将血压降至正常范围后，一般疼痛会自然消失。
由于环境影响、强光照射、食物影响等因素相互作用，导致血管神经发生持续性的收缩或痉挛，也可以导致头顶正中间疼痛，非甾体类抗炎药或麦角类等特异性止痛药治疗效果比较好。
在头顶附近发生颅内肿瘤或者是颅外肿瘤，可以对头顶正中间的神经肌肉产生压迫或刺激引起疼痛。手术切除肿瘤或者是进行化疗、放疗等治疗后疼痛可以改善。
脑动脉硬化、畸形、脑梗塞、脑出血等情况，可以使头顶部的血液循环发生障碍，神经功能受损而引起疼痛，积极治疗原发病后疼痛会逐渐缓解。
头顶及其附近部位有明显的皮炎、疖肿等情况发生，炎症刺激也可以导致疼痛，抗炎对症治疗后疼痛会好转。
头顶正中部受到外力的撞击挤压，或者是有人抻拽头发，可以导致头皮及其软组织损伤引起疼痛，一般经过休息后，症状会逐渐的好转。
头部接触了某些特殊物质或者是使用染发剂后导致过敏反应发生，也可以出现头顶正中间的疼痛，抗过敏治疗会取得较好的效果。
各种原因导致脑组织的血液供应不足，造成神经血管功能失调时，也可以导致头顶正中间的疼痛，应用改善血液循环及对症治疗后，疼痛会有改善。
