遗传因素中有两类基因与阿尔茨海默病相关。一类是致病基因，如淀粉样蛋白前体基因APP，位于21号染色体；早衰基因（早老素基因），位于14号染色体；以及早老素2基因，位于1号染色体。携带有淀粉样蛋白基因或早老素基因的人群，有100%的几率发展成阿尔茨海默病。如果携带早老素2基因突变，发病几率约为95%。
此外，阿尔茨海默病的风险基因之一是载脂蛋白E基因（ApoE），这是目前较为公认的风险基因。ApoE基因有三种不同的等位基因，其中APOE4等位基因参与淀粉样蛋白的生成。如果APOE4基因为阳性，发展成阿尔茨海默病的风险会增加。携带一个ApoE等位基因的人，患阿尔茨海默病的风险是正常人的三倍多一点；如果携带两个ApoE等位基因阳性，风险可增加至正常人的8到12倍。
因此，ApoE等位基因的携带对于认知障碍的发生具有提示和预示作用。
