慢性根尖周炎治疗的难度需根据患牙炎症情况、患者自身免疫力等判断治疗难易程度，不能一概而论。患者应及时配合医生进行规范有效的治疗，可以保留患牙，预后一般都良好，但也存在复发的可能性。
慢性根尖周炎是由于根管内长期存在感染及病原刺激物，而导致根尖周组织呈慢性炎症反应，病变类型主要有根尖周脓肿、根尖周囊肿、根尖周致密性骨炎。因此治疗时需彻底去除感染及病原刺激物。
临床上比较常用的治疗方法是根管治疗，可以彻底清除根管内的感染物，并使用填充材料，将根管严密填充做永久性的治疗。较大的根尖周病变，尤其是根尖周囊肿，需要在根管治疗基础上，进行根尖周手术治疗。
