通常情况下对于肝门胆管癌的治疗方式主要以手术治疗为主，根据具体分型的不同，其手术方式会有不同程度的差别。
- 如果肿瘤位于肝总管，没有侵犯左右肝管汇合部时，或者肿瘤侵犯汇合部，但尚未侵犯左肝管或右肝管时。可选择将肝门胆管、肝外胆管以及胆囊切除，并且给予胆管空肠吻合术治疗。
- 如果肿瘤已侵犯左肝管或已侵犯右肝管，这种情况下根据侵犯肝管的不同，可以进行胆管癌切除术加同侧肝切除术，并给予对侧胆管空肠吻合术治疗。
- 如果肿瘤已同时侵犯左右肝管，这种情况下，少数可给予肝门胆管切除手术治疗，而由于多数已无法给予手术切除，所以，一般情况下单纯给予胆道引流手术治疗。
