尖锐湿疣病毒有可能终身携带，也有可能被清除体外。引起尖锐湿疣的病毒主要是低危型HPV病毒，也就是人乳头瘤病毒，如HPV6、HPV11等亚型。少数为高危型HPV病毒。
不论是治疗尖锐湿疣的药物，还是物理或者手术方法，都不能彻底杀灭HPV病毒。人体感染了低危型HPV病毒后，单纯依靠各种医学手段进行治疗，难以将病毒彻底清除，通常达不到根治的效果，所以，有可能终身携带。
不过，一部分患者在经过免疫调节治疗及饮食和生活方式干预后，身体免疫功能进一步增强，可以通过自身免疫系统的作用将HPV病毒清除干净，达到转阴的效果。
