胃肠间质瘤低危阶段，手术治疗后不需要再进行其他治疗；中危、高危胃肠间质瘤，手术治疗后还需要做后续治疗。
低危性胃肠间质瘤，属于良性病变，手术治疗可以达到完整切除的效果，术后一般不会复发，所以，不需要再进行其他治疗。
中危或者高危胃肠间质瘤，属于恶性病变，术后有复发转移的风险，通常都需要进行术后靶向药物治疗，治疗周期1-3年，在治疗期间需要定期复查，如果在药物治疗期间仍然出现病灶复发或转移，需要及时调整治疗方案。
另外，胃肠间质瘤手术后应给予适当的营养支持，以增强人体免疫能力。
