骶管囊肿压迫神经时，可引起大小便异常、阳痿、下肢麻木和疼痛、会阴、肛门、阴道等部位疼痛，可通过手术治疗解除压迫症状，或通过药物暂时缓解症状。
较小的骶管囊肿压迫神经偶尔出现的并不严重的疼痛可以使用止痛药物和神经营养药物；骶管囊肿压迫神经导致肠蠕动减慢、引起便秘时，可选用乳果糖、番泻叶等药物刺激肠蠕动，缓解压迫所致的便秘，促进排便。
药物保守治疗无效时，需通过手术治疗解除神经受压，常用囊肿壁大部切除+神经根袖套成形术，可辅助自体脂肪或肌肉填塞、骶管重建等术式。由经验丰富的神经外科医生进行手术治疗是彻底缓解神经压迫，实现治愈的关键。
