脂肪肝严重可能会导致肝细胞长时间反复受损不能再生，而被纤维化组织代替，导致肝纤维化或肝硬化。肝硬化进入失代偿期可能会出现腹水（会表现为腹胀、食欲差）、肝性脑病（表现为性格改变甚至昏迷）、食管胃底静脉曲张导致的上消化道出血（表现为呕血或黑便，严重时可以危及到生命）。再严重者可能会导致肝衰竭甚至肝癌，这两种疾病都是致命的。
脂肪肝患者常常会伴有高血脂、高血压或高血糖，也需引起注意。重度脂肪肝患者，还常常很容易得心脑血管方面的疾病。
患有重度脂肪肝的患者，体内代谢紊乱，多余的脂肪组织无法被肝脏分解，会聚集在血液和血管壁中，造成血管壁增厚，动脉粥样硬化狭窄，严重的时候会导致血管闭塞。
