当患者高度怀疑为恶性结节或者对结节的性质不能做出准确判断时，则需要做甲状腺穿刺来明确诊断。
超声检查或其他影像学检查提示，甲状腺结节没有完整的包膜、与周围组织之间界限不清、血流比较丰富、有微钙化现象等，如果具有其中任何一种特点，都有患甲状腺癌的可能，这个时候通常都需要进行甲状腺穿刺，提取少量的组织细胞进行病理检查，明确结节的具体性质。
穿刺活检是对甲状腺结节性质进行确诊的主要依据，如果最终检查结果为恶性结节，需要尽快手术。
