儿童脑肿瘤的发生原因包括内因和外因。
内因是指脑肿瘤患儿自身的基因突变引起，比较被学界接受的假说是二次突变学说，就是先有患儿自身基因突变的基础，此时并不马上就会生长脑肿瘤，但这是引起脑肿瘤的基础。
外因指的是在之后的某个时机，外界的某些危险因素，包括射线辐射、化学污染等，在不正常的基因突变的基础之上再次发生突变，此时就可能会引起脑肿瘤的生长。还有一部分脑肿瘤和遗传相关，如神经纤维瘤病等。
综上所述，儿童脑肿瘤的原因与自身的基因突变、后天环境因素、先天的遗传因素都有关。
