通过MRI检查可以明确脊髓拴系综合征的结构改变情况，如果是单纯的终丝牵拉型脊髓拴系综合征，MRI检查主要表现为脊髓曲度变直，有时可以见到脂肪化的增粗终丝，部分孩子可伴有脊髓圆锥低位以及脊髓空洞的现象，不好判断时可以进行俯卧位腰部核磁加以鉴别，俯卧位时，脊髓圆锥可以随体位改变和重力的影响而下落，则可以排除脊髓栓系。
如果脊髓拴系合并有骶尾部先天脂肪瘤，会发现局部脂肪瘤的异常信号影以及占位效应。有皮毛窦、脊柱裂时，通过MRI检查时会发现局部窦道以及椎板闭合不全或骨质缺损的现象。
