女性尿路感染最常见的感染途径是逆行感染，主要是通过尿道口、阴道、肛门这个体系来发生逆向的感染而导致的。这个主要是与女性特有的生理结构有关系，因为女性尿道与男性尿道截然不同，女性尿道表现的为平直、短、宽，容易受到逆行感染的威胁。
如果存在有一些解剖变异，像处女膜伞、处女膜融合，就会加重这种危险。
同时，在几个生理周期像妊娠期、月经期以及更年期以后，也会造成尿路感染的发生频率的升高。
同时在夫妻正常的性生活过程当中，由于挤压作用，可以将阴道的分泌物挤压进入到尿道，从而造成尿路感染的反复发生。
加之有些女性可能应用了一些阴道内的杀精子剂，会破坏阴道内的酸性环境，这都是引起女性尿路感染高发的一个重要因素。
