自身免疫性脑炎的治愈率通常比较高，甚至可高达80%左右。对于早期发现者，若及时进行治疗，一般恢复良好，不影响自然寿命。但对于错失治疗或重症者，是有一定的死亡率的。
自身免疫性脑炎是一个自身免疫性疾病，是因为针对脑细胞表面或细胞内的蛋白质产生的抗体而引发的脑炎，所以自身免疫性脑炎种类非常多，原则上脑细胞表面或细胞内有多少个蛋白就有多少种脑炎。一旦确诊，需要给予糖皮质类固醇激素、血浆置换、单隆抗体等，来进行免疫调节或免疫抑制治疗。
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