卵巢囊肿大多数为良性肿瘤，只有极少部分患者会发生癌变。
- 有卵巢囊肿的女性应定期做相应检查，比如妇科的肿瘤标志物检查，如有明显异常，提示恶性可能性大。
- 另外可以通过超声检查观察卵巢囊肿的生长速度，如果卵巢囊肿生长很快，一个月长一到二倍，则需要提高警惕，有恶变的可能性。确定卵巢囊肿是否为恶性，需要通过手术治疗，手术切除后行病理检查，来确定病变的种类和恶性程度。
大部分卵巢囊肿的患者预后较好，并且生理性的卵巢囊肿可以在未经治疗的情况下，经过几个月经周期后自行消退。卵巢癌依据期别不同预后不同，晚期卵巢癌预后极差。
