急性鼻窦炎大多是在上呼吸道感染的基础上伴发的鼻窦黏膜感染，多为病毒或细菌直接造成的感染性炎症。经过局部和全身的抗炎和抗感染治疗多可治愈。如果合并解剖因素、变态反应、气压伤、腺样体肥大、鼻外伤等因素导致的急性鼻窦炎，治疗较为复杂，也可转为慢性。
慢性鼻窦炎的病因比急性鼻窦炎复杂的多，除了由急性细菌性鼻窦炎发展而来以外，过敏反应、真菌侵袭、细菌形成的生物膜和超抗原，还有解剖发育异常都是慢性鼻窦炎的病因。这些因素中除了解剖异常可以通过手术彻底根治以外，其余病因都可能长期影响鼻窦的黏膜状态引起慢性炎症。
因此，慢性鼻窦炎的治疗提倡药物及手术的综合治疗。手术可以修正解剖畸形，清除一些不可逆的病变组织，如鼻中隔偏曲、鼻甲肥大和鼻息肉等。而药物治疗可以控制慢性炎症的发展。
通过规范的治疗，大多数患者可取得满意的治疗效果。少部分患者由于发病原因复杂甚至不明确，可成为难治性鼻-鼻窦炎，治疗较为困难，可能需长期用药。
