慢性鼻窦炎的治疗包括药物治疗和手术治疗。慢性鼻窦炎的人群如果没有鼻息肉，可首选药物治疗，如果同时出现鼻腔结构异常或者鼻息肉时，可以行手术治疗。具体治疗方法如下：
药物选择包括鼻喷糖皮质激素类药物，这是治疗鼻窦炎的一线药物，主要可抑制异常的免疫反应，还能减轻鼻腔所带来的水肿现象。药物治疗还包括抗生素治疗，可以选择大环内酯类药物或头孢类药物。还包括抗组胺药，也就是常说的抗过敏药，主要针对一些由于呼吸道过敏因素导致的鼻窦炎，此外还有黏液促排剂、鼻腔盐水盥洗和一些中药等。
对于药物治疗无效，甚至出现鼻息肉或者是由于明显鼻腔鼻窦解剖结构异常导致鼻窦炎的患者，就要考虑采取手术治疗了，主要包括鼻内镜下鼻腔鼻窦手术。对于儿童还包括和腺样体切除手术。个别患者出现了鼻窦炎导致眼眶或颅内并发症时也要尽早手术。
