引起怀孕胚胎停育的原因较为复杂，可能和以下因素有关：
1、内分泌因素。胚胎着床以及发育均依赖内分泌系统，如果内分泌彼此协调作用下降，均有可能会导致流产。
2、子宫异常。子宫内的环境，均有可能会对胚胎的发育产生影响。如子宫内膜过薄，不利于胚胎摄取营养成分，也可能会引起胎停育。
3、环境因素。环境因素较为复杂，例如高温、噪音以及过度的刺激等。除此之外，在怀孕早期或备孕期间，接触有放射性的物质，均可造成胚胎损伤，甚至停止发育。
