肝内胆管结石，虽然症状可能会有自发性的减轻，但是绝大多数都不会自愈，相反肝内胆管结石会刺激局部胆管引起狭窄，进一步加快肝内胆管结石的形成，形成结石——胆管狭窄——结石的恶性循环。
之所以有肝内胆管结石的发生，就是由于肝内的胆道系统存在相关的病变，比如肝管内存在慢性的炎症刺激，或者是由于体质因素导致肝内胆汁的性质发生变化，这种变化是不会自行消失的，需要通过相关的处理才能有改变。并且胆结石一旦形成，其体积会逐渐变大，数量也会随时间而增加。
对于体积比较小的结石，可能会随着胆汁排出肝外，使症状得到暂时性的缓解，但是这种几率是很小的。
