对于直径超过10厘米，或者因囊肿压迫周围组织出现症状，以及合并感染的肝囊肿，或者是寄生虫性肝囊肿，建议进行手术治疗。通常情况下，绝大多数肝囊肿为单纯性肝囊肿，这种肝囊肿较小，生长缓慢，是肝脏的一种良性病变，对于这种没有症状的肝囊肿无需任何治疗。少部分体积过大的肝囊肿，由于会压迫到周边组织引起上腹胀痛或进食后腹胀，如果合并感染或囊内出血则会出现急性腹痛、发热、黄疸，这时就应及时采取手术治疗。对于特殊的寄生虫性肝囊肿，即肝包虫病，都应采取手术治疗。
