肩胛骨缝发生疼痛的原因有很多,具体如下:1、软组织损伤,若是外力撞击,可能会导致肩胛骨处肌肉损伤、粘连,引起疼痛。2、肩周炎,肩周炎又称冻结肩,主要是由于外伤、受凉等因素导致肩关节出现的无菌性炎症,主要的症状是肩关节周围疼痛以及严重的活动受限,有时可以表现为肩胛骨周围的疼痛。3、肩背部筋膜炎,如果肩背部由于不良的姿势、外伤、受凉等因素,导致深筋膜部位出现无菌性炎症,有可能出现肩胛骨周围的疼痛。4、部分骨质疏松的老年患者,也可能会出现肩胛骨缝的疼痛。