宫颈萎缩的原因可以分为两类，生理性和病理性的。生理性的宫颈萎缩见于绝经期女性，女性绝经后体内雌孕激素水平明显降低，可出现宫颈萎缩，同时会伴有其他生殖器官的萎缩，例如子宫体、卵巢，这种生理性的宫颈萎缩是每个女性都会面临的生理现象，不需要处理。
病理性宫颈萎缩多见于育龄期女性，这种情况通常考虑为卵巢早衰所致，需要到医院抽血检查性激素六项、抗苗勒管激素、超声了解双侧窦卵泡数目等评估卵巢功能。若为卵巢早衰者，患者往往有闭经、潮热、盗汗、阴道干涩、性交疼痛等表现，需要在医生指导下行激素替代治疗。若由于患者病情需要切除双侧卵巢，术后雌激素极低，也可发生宫颈萎缩。
