男科和泌尿外科的主要区别是治疗疾病的不同。男科主要是用来治疗男性的生殖泌尿系统的疾病，比如包皮过长或包茎、精索静脉曲张、前列腺炎、性功能障碍等。而泌尿外科可以用来治疗各种各样的泌尿系统的疾病，比如泌尿系感染、尿路结石、膀胱肿瘤、先天性尿道畸形、前列腺增生、尿路狭窄等。但是很多男科疾病与泌尿外科疾病范畴交叉，某些情况下男科被划分为泌尿外科当中。有些医院没有单独设男科，患者可以到泌尿外科治疗相关的疾病。
