胆囊摘除后遗症比较少，随着时间的延长，后遗症慢慢都可以消失。一般在胆囊摘除后，短期内患者的后遗症主要是影响消化功能，表现为消化不良、恶心、腹泻、呃逆、反酸等症状。如果患者症状明显，可以口服一些利胆药和促进胃肠道蠕动的药物以解除症状。
短期内患者可以表现为腹泻，但也只是在一小部分病人当中容易发生，尤其是在进食油腻食物后，所以患者如果有腹泻症状，尽量避免服用油腻食物，可以服用止泻药治疗。腹泻会随着时间的延长，慢慢有所好转。
另外，常见的后遗症就是手术后会有切口疼痛、胃肠道功能恢复延迟、呕吐以及和手术相关的出血、胆瘘感染的并发症等，但是随着目前医疗技术的发展与成熟，上述情况发生也是明显降低的。
