乳腺囊肿为常见良性疾病，恶变率低于千分之一；部分囊肿随年龄增长、乳腺退化可自行消失。囊肿有多发性、对称性，一般情况下不需要手术治疗，而且手术也无法将所有囊肿都切除干净；如果能触及较大囊肿，治疗上可用注射器抽吸，一般抽吸1~3次即可治愈。只有两种情况需要手术，如抽吸液体为血性应立即停止抽吸，进行手术活检；如彩超可见囊壁有肿物或乳头状突起时，需要进行手术活检。
常规还可进行乳腺钼靶检查排除恶变情况，但囊肿在钼靶上可以表现为良性钙化影响判断，乳腺彩超对囊肿诊断优于钼靶。药物治疗囊肿效果不确定，一般不建议长期服药；所以定期彩超复查最为合理。
