桥本甲状腺炎的治疗主要是针对继发性甲减进行治疗。
桥本甲状腺炎的发生主要是由于自身抗体的存在，针对此类抗体的治疗一般无理想效果，且个体差异较大，所以目前对于桥本甲状腺炎这个疾病本身一般是采取观察治疗，在日常生活中可以限碘饮食。
因为自身抗体会对甲状腺滤泡细胞造成破坏，所以桥本甲状腺炎患者后期会发生甲减。甲减患者会出现基础代谢下降、交感易兴奋的症状，对于患者有一定的影响，所以应该针对甲减进行治疗。一般选用甲状腺激素替代疗法来治疗甲减。
