胆管结石的治疗需要根据患者的病情、结石位置来决定。
对于无不适症状且无梗阻出现的肝内胆管结石患者，症状较轻，此时可以不做特殊的治疗，定期随访进行CT检查动态观察结石情况即可。
如果结石数量过多且已经形成了梗阻，患者症状一般较严重，此时一定要及时接受手术治疗。手术以取出结石、解除梗阻为主。如果胆囊也有大量结石，还需要将胆囊切除。
还可以采取介入下的经内镜逆行性胰胆管造影（ERCP）技术经过十二指肠乳头将结石从胆管内逆行取出。
