肠道功能紊乱的症状一般有：腹泻、腹胀、便秘、腹痛、厌食等。临床对肠道功能紊乱，首先要确定是功能性的还是器质性的，如果怀疑有器质性疾病，如结肠肿瘤、肠结核或者炎症性肠病等，就要必须及时完善相关检查，做进一步治疗。在排除器质性病变前提下，考虑是功能为主的紊乱，可在医生指导下对症服用些调节胃肠道菌群和功能的药物。
除此外，精神因素是本病发生的主要原因，包括情绪紧张、焦虑、生活与工作中的困难、烦恼，还有生活不规律、经常熬夜、饮食习惯不好、压力大等也能引起。 对于这种首先要重视心理卫生，心理健康；饮食、生活要规律，多运动，学会释放压力。
