目前研究认为桥本氏甲状腺炎是因为自身免疫功能紊乱，血清存在针对甲状腺的自身抗体，这些抗体攻击甲状腺，引起甲状腺细胞破坏所致，可能与以下因素有关：
1、遗传：目前的研究认为桥本氏甲状腺炎和遗传关系密切，受多个遗传基因调控，约半数患者有相关家族史。
2、环境：碘摄入量是影响桥本氏甲状腺炎发生、发展的重要环境因素，碘摄入量越多，发生桥本氏甲状腺炎的概率就越大；核辐射可能也是本病的一个致病因素。
3、免疫异常：T淋巴细胞先天性量或质的异常可能也是引起桥本氏甲状腺炎的重要原因，但具体机制尚不明确。
